CheShift-2 es un web server diseñado para validación de proteínas. CheShift-2 predice los desplazamientos químicos de los 13Cα a partir de un archivo pdb. Alternativamente CheShift-2 es capaz de realizar una validación por residuo, para lo cual el usario debe proveer las coordenadas de una proteína (archivo .pdb) y el conjunto de desplazamientos químicos de 13Cα observados.

Actualmente hay cuatro plugins de PyMOL disponibles:

Azahar extiende las capacidades de PyMOL para visualizar, analizar y modelar glicanos y moléculas glucoconjugadas.

Optimize permite minimizar la energía de moléculas.

Cheshift permite validar proteínas, mediante CheShift-2, sin abandonar el entorno familiar de PyMOL.

Dehydron permite computar y visualizar dehydrones en proteínas.

CheSweet: módulo de Python para el cálculo rápido y exacto de los desplazamientos químicos de 13C de glicanos.

13Check_RNA: herramienta para evaluar los desplazamientos químicos de 13C de ARN.

BIOS colabora con los siguientes proyectos:

PyMC3 es un paquete de Python para modelado estadístico Bayesiano y Aprendizaje Automático Probabilístico que se centra en algoritmos de Monte Carlo con cadenas de Markov avanzado y ajuste variacional. Su flexibilidad y extensibilidad lo vuelven aplicable a una amplia variedad de problemas.

ArviZ (pronunciado "AR-vees") es un paquete de Python para análisis exploratorio de modelos Bayesianos. Incluye funciones para el análisis de posteriors, y para chequeo, comparación y diagnóstico de modelos.





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